Um grupo pequeno de universidades usa o Enem apenas para preencher as vagas remanescentes dos seus processos seletivos. O seu principal representante era a Universidade de Brasília (UnB), mas ela decidiu aderir ao Sistema de Seleção Unificada (SiSU) para metade das vagas a partir do ingresso para 2014.
Diferente do que alguns imaginam, as vagas remanescentes não são as que sobram da 1ª chamada. São contabilizadas apenas as carteiras restantes após todas as convocações de classificados, ou seja, dos cursos cuja oferta de vagas foi maior do que a quantidade de candidatos não eliminados.
Após a última chamada do vestibular, a universidade divulga um edital com as vagas remanescentes e a forma de concorrer. O candidato só precisa se inscrever informando o número de cadastro no Enem. O resultado sai poucos dias depois, já que não é preciso fazer nenhuma correção de prova.
Universidades que utilizam o Enem para preenchimento das vagas remanescentes:
Região Sudeste
PUC-Campinas - Pontifícia Universidade Católica de Campinas
Região Sul
UEL - Universidade Estadual de Londrina
Unicentro - Universidade Estadual do Centro-Oeste